В октябре того же года, находясь в служебной командировке на саммите стран БРИКС в Гоа (Индия), Улюкаев, как установило предварительное следствие, потребовал от Сечина $2 млн за то, что именно он организовал положительное заключение на сделку. 

По данным обвинение, Сечин согласился выполнить противоправные требования Улюкаева, так как опасался, что покупка «Башнефти» может быть сорвана. После этого он обратился в ФСБ с заявлением о вымогательстве взятки. 14 ноября 2016 года Улюкаев приехал в центральный офис «Роснефти», где под негласным контролем чекистов получил лично от Сечина сумку с долларами, положил ее в свой автомобиль и сразу же был задержан. Вскоре СК РФ предъявил ему обвинение в совершении преступления, предусмотренного ч. 6 ст. 290 УК (получение взятки в особо крупном размере). Басманный суд в качестве меры пресечения избрал для обвиняемого домашний арест.

В ходе судебного заседания судья Лариса Семенова спросила у Улюкаева, понятно ли ему обвинение. Подсудимый ответил утвердительно, подчеркнув, что свою вину он не признает. 

Улюкаев считает, что в основе его уголовного преследования лежит «гнусная провокация». Ее участниками бывший министр назвал сотрудников ФСБ, Сечина и тогдашнего вице-президента «Роснефти» начальника ее службы безопасности Олега Феоктистова. Само же обвинение, считает подсудимый, было составлено СК РФ «исключительно» на показаниях главы «Роснефти», настаивавшего, что у него вымогали взятку за положительный отзыв на сделку с «Башнефтью». 

При этом, считает Улюкаев, доказательства его невиновности были проигнорированы следствием. По версии подсудимого, это связано с несопоставимым политическим весом, который имеет он сам и глава «Роснефти».

Улюкаев также заявил, что сотрудники ФСБ следили за ним несколько недель, но так и не дождались момента для его задержания. Тогда ему позвонил сам Сечин, пригласивший на встречу в офис «Роснефти». Обсудить они должны были дела корпорации, но вместо этого Улюкаев, по его же словам, получил сумку денег.

Адвокаты Улюкаева нашли существенные расхождения между данными, оглашенными гособвинением в суде, и обвинительным заключением, с которым они ознакомились перед разбирательством. 

В частности, в них по-разному трактовались возможные противодействия сделке по продаже «Башнефти» со стороны бывшего министра. На этом основании адвокаты Улюкаева попросили судью вернуть дело в Генпрокуратуру, утверждавшую обвинение, на исправление ошибок. 

В ответ на это прокурор заявил, что, выступая в суде, он не должен пересказывать дословно обвинительное заключение, а может довести до участников заседания его фабулу. При этом обвинитель упрекнул защиту бывшего чиновника в том, что, требуя вернуть дело в Генпрокуратуру, она намеренно пытается затянуть процесс. Судья ходатайство защиты подсудимого отклонила. 

Пресс-секретарь «Роснефти» Михаил Леонтьев заявил, что не будет комментировать высказывания подсудимого Улюкаева, который, по его версии, требовал незаконное вознаграждение за исполнение своих служебных обязанностей. По его словам, суд, получивший исчерпывающие материалы по этому уголовному делу, сам разберется во всех его обстоятельствах и деталях. 

Разбирательство продолжится 1 сентября.